Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCANO14594 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCANO14594 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCANO14594 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCANO14594 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCANO14594 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCANO14594 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCANO14594 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCANO14594 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCANO14594 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCANO14594 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms