Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CITO14578 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CITO14578 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CITO14578 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CITO14578 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITO14578 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CITO14578 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITO14578 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITO14578 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CITO14578 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITO14578 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITO14578 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITO14578 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CITO14578 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITO14578 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITO14578 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CITO14578 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITO14578 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms