Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRTO14522 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
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