Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME4O00746 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME4O00746 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME4O00746 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NME4O00746 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME4O00746 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NME4O00746 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NME4O00746 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NME4O00746 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME4O00746 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME4O00746 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME4O00746 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms