Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXLO00592 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXLO00592 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXLO00592 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXLO00592 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXLO00592 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXLO00592 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXLO00592 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PODXLO00592 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PODXLO00592 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXLO00592 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PODXLO00592 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PODXLO00592 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXLO00592 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXLO00592 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXLO00592 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXLO00592 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXLO00592 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms