Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIN1O00499 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIN1O00499 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIN1O00499 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIN1O00499 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIN1O00499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIN1O00499 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIN1O00499 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BIN1O00499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIN1O00499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIN1O00499 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIN1O00499 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIN1O00499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIN1O00499 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIN1O00499 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIN1O00499 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIN1O00499 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIN1O00499 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIN1O00499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms