Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
O00370 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
O00370 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
O00370 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
O00370 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
O00370 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
O00370 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
O00370 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
O00370 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
O00370 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
O00370 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
O00370 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
O00370 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
O00370 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
O00370 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms