Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CDO00329 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms