Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms