Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms