Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms