Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL1BA8MQ27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL1BA8MQ27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms