Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GABRR3A8MPY1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR3A8MPY1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms