Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PP2D1A8MPX8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PP2D1A8MPX8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms