Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM23A6NLE4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms