Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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