Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOL1A6NHN0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOL1A6NHN0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms