Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC160A6NGH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms