Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms