Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms