Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms