Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSDA5PKW4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms