Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1411.3 ms