Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPDC1A2A3K4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms