Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM72A0PK05 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms