Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms