Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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