Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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