Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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MAP1LC3CQ9BXW4 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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MAP1LC3CQ9BXW4 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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