Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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