Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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