Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms