Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms