Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXD4Q12950 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXD4Q12950 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXD4Q12950 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXD4Q12950 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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