Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP4P49662 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms