Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms