Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDSP20132 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDSP20132 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDSP20132 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDSP20132 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms