Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTRB1P17538 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms