Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL137845.1-201ENST00000340681 1110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 C2orf40-202ENST00000409944 799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC005090.1-201ENST00000433356 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PYM1-207ENST00000557259 775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC092115.2-201ENST00000562696 575 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC079322.1-201ENST00000568345 1135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KCNMB3-203ENST00000392685 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 YEATS2-AS1-201ENST00000425008 2442 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TNMD-201ENST00000373031 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RNASE3-201ENST00000304639 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TPM3P4-201ENST00000425942 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL389885.1-201ENST00000447227 384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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