Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms