Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms