Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms