Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM187AA6NFU0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM187AA6NFU0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms