Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms