Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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USP35Q9P2H5 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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