Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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