Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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