Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT13Q9NUP7 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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