Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms