Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms